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一文搞懂細(xì)胞凋亡檢測:Annexin V/PI、JC-1、Caspase-3活性、TUNEL、PARP、Sub-G1 等從原理到多參數(shù)實(shí)操

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細(xì)胞凋亡(Apoptosis一種程序性細(xì)胞死亡 (PCD),其特征包括細(xì)胞皺縮、染色質(zhì)凝聚、膜起泡和核碎裂。它對(duì)于形成和維持健康組織至關(guān)重要,幾乎所有生物體在早期胚胎發(fā)育過程中都依靠細(xì)胞凋亡來清除多余細(xì)胞。它也是維持組織穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),通過清除衰老或受損細(xì)胞來平衡細(xì)胞群體的增殖與死亡。

然而當(dāng)細(xì)胞凋亡過程紊亂時(shí),后果可能十分嚴(yán)重。過度凋亡會(huì)導(dǎo)致發(fā)育異常和神經(jīng)退行性疾病,而凋亡不足則可能使受損或不需要的細(xì)胞存活,從而促進(jìn)癌癥進(jìn)展、自身免疫疾病和慢性病毒感染。 

很多人在做凋亡實(shí)驗(yàn)時(shí),*常問的坑就是:“Annexin V 陽性了,但 Caspase-3 沒激活?”“JC-1 紅綠比下降了,是凋亡還是壞死?”“Sub-G1 峰怎么算比例?”今天這篇文章從凋亡原理入手,系統(tǒng)梳理主流檢測方法:Annexin V/PI、JC-1、Caspase-3/7活性、7-AAD、TUNEL、PARP裂解、Sub-G1、Cytochrome c 釋放等。重點(diǎn)講解原理、實(shí)驗(yàn)步驟、數(shù)據(jù)解讀和多參數(shù)組合(流式為主,但也包括 WB、IF、顯微鏡等)。讀完后,你能全面掌握凋亡實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)與驗(yàn)證,避免假陽性/假陰性。

核心提醒:凋亡分階段
早期:磷脂酰絲氨酸(PS)外翻、ΔΨm 下降、Caspase 激活
中期:DNA 片段化、細(xì)胞收縮
晚期:膜破裂、壞死樣特征
凋亡 vs. 壞死 vs. 焦亡:需多標(biāo)志物區(qū)分(Annexin V+ PI- = 早期凋亡;Annexin V+ PI+ = 晚期凋亡/壞死)。

一、細(xì)胞凋亡生物學(xué)基礎(chǔ)

凋亡分兩條主要通路:

  • 外源性(死亡受體通路)
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Fas/TNF-α 等配體 → 死亡誘導(dǎo)信號(hào)復(fù)合物(DISC) → Caspase-8 → Caspase-3/7 執(zhí)行。
  • 內(nèi)源性(線粒體通路)
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應(yīng)激 → Bcl-2 家族調(diào)控 → 線粒體外膜通透(MOMP) → Cytochrome c 釋放 → Apaf-1/Caspase-9 → Caspase-3/7。

關(guān)鍵事件:PS 外翻、ΔΨm 下降、Caspase 級(jí)聯(lián)激活、DNA 斷裂(180-200 bp 多聚體)、細(xì)胞收縮、凋亡小體形成。

二、主流檢測方法原理與優(yōu)缺點(diǎn)

1. Annexin V/PI 雙染(流式金標(biāo)準(zhǔn))

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原理:Annexin V 結(jié)合外翻的 PS(Ca2? 依賴),F(xiàn)ITC/APC 標(biāo)記;PI 進(jìn)入膜破裂細(xì)胞。早期凋亡:Annexin V+ PI-;晚期:Annexin V+ PI+;壞死:Annexin V- PI+。

優(yōu)點(diǎn):活細(xì)胞兼容、早期檢測;缺點(diǎn):需 Ca2? 緩沖液,背景需對(duì)照。

2. JC-1 檢測線粒體膜電位下降

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原理:JC-1 在高 ΔΨm 聚合紅光,低 ΔΨm 單體綠光。凋亡早期 ΔΨm 崩解 → 紅/綠比下降。

優(yōu)點(diǎn):內(nèi)源通路早期標(biāo)志;缺點(diǎn):非特異(其他損傷也可降 ΔΨm),需 CCCP 陽性對(duì)照。

3. Caspase-3/7 活性檢測

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AMC)或抗體檢測激活 Caspase-3/7。流式用熒光偶聯(lián)底物或抗活性 Caspase-3 抗體。

優(yōu)點(diǎn):執(zhí)行階段特異;缺點(diǎn):需裂解或固定,活細(xì)胞探針(如 CellEvent)更好。

4. 7-AAD 或 PI 單染(晚期凋亡/壞死)

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7-AAD 類似 PI,但更特異進(jìn)入膜破裂細(xì)胞。常與 Annexin V 組合,區(qū)分晚期凋亡(Annexin V+ 7-AAD+)與壞死。

5. TUNEL 檢測(DNA 斷裂)

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原理:TdT 酶在 DNA 3'-OH 末端標(biāo)記熒光 dUTP。標(biāo)記斷裂 DNA 末端。

優(yōu)點(diǎn):特異 DNA 片段化;缺點(diǎn):晚期標(biāo)志,固定后操作。

6. PARP 裂解(WB)

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原理:Caspase-3 切割 PARP(116 kDa → 89 kDa 片段)。WB 檢測裂解片段比例。

優(yōu)點(diǎn):下游執(zhí)行證據(jù);缺點(diǎn):群體平均,無法區(qū)分亞群。

7. Sub-G1 峰(PI 染色中的凋亡碎片)

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原理:凋亡細(xì)胞 DNA 寡核小體間斷裂 → 小片段泄漏 → PI 熒光 <2N(Sub-G1 峰)。

優(yōu)點(diǎn):簡單;缺點(diǎn):非特異(壞死也可),需結(jié)合 Annexin V 驗(yàn)證。

8. Cytochrome c 釋放(IF / WB)

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胞質(zhì) → IF 胞質(zhì)彌散(非點(diǎn)狀線粒體),或分離線粒體/胞質(zhì)組分 WB。

三、典型實(shí)驗(yàn)操作流程

方案1:Annexin V/PI 流式雙染

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  1. 細(xì)胞處理后,溫和消化(胰酶-EDTA 短時(shí)間)或直接收集懸浮細(xì)胞,4°C PBS 洗 2 次。
  2. 用 1× Annexin V Binding Buffer 重懸至 1×10? cells/mL。
  3. 加 FITC-Annexin V(5 μL/100 μL 細(xì)胞懸液)+ PI(或 7-AAD,1–5 μg/mL),室溫避光孵育 15–20 min。
  4. 補(bǔ)加 400 μL Binding Buffer,1 h 內(nèi)上機(jī)(FL1: Annexin V ~530 nm;FL3: PI/7-AAD ~650 nm)。
  5. 門控:FSC/SSC 排除碎片和雙聯(lián)體;設(shè)單染對(duì)照補(bǔ)償串色。
  6. 陽性對(duì)照:H?O? 或 staurosporine 處理;陰性對(duì)照:不加 Annexin V 或無 Ca2? 緩沖液。

方案2:JC-1 染色(線粒體膜電位檢測)

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  1. 細(xì)胞重懸于預(yù)熱培養(yǎng)基或 PBS,濃度 1×10? cells/mL。
  2. 加 JC-1 工作液(2–5 μg/mL 或 10 μM,根據(jù)試劑盒推薦),37°C 避光孵育 15–30 min。
  3. 4°C PBS 洗 2 次(去除未結(jié)合 JC-1,避免背景),重懸于 PBS 或 Binding Buffer。
  4. 流式上機(jī):488 nm 激發(fā),F(xiàn)L1 通道(綠色單體 ~530/30 nm),F(xiàn)L2/FL3 通道(紅色聚合物 ~585/42 或 610/20 nm)。也可熒光顯微鏡拍照。
  5. 陽性對(duì)照:CCCP(10–50 μM)處理 15–30 min 誘導(dǎo)完全去極化;陰性對(duì)照:未處理健康細(xì)胞。
  6. 數(shù)據(jù)分析:計(jì)算紅/綠 MFI 比值(或圈出“綠色高”亞群比例作為去極化細(xì)胞%);建議用 FlowJo 做紅 vs. 綠雙參數(shù)圖。

方案3:Caspase 活性流式檢測

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  1. 推薦活細(xì)胞探針(如 Cell Meter?檢測試劑盒):按試劑盒說明,1×10? cells/mL 加入 1–2× 工作濃度探針,37°C 避光孵育 1–4小時(shí)(期間可輕搖)。
  2. 可選雙染:孵育結(jié)束后加DNA 染料(例如Green-DCS 用于死細(xì)胞)標(biāo)記細(xì)胞,繼續(xù)室溫 5–10 min。
  3. 上機(jī):FL3 通道(APC Caspase 活性 ~561 nm),F(xiàn)L1 通道(FITC通道 ~488 nm)。
  4. 陽性對(duì)照:staurosporine(1 μM,4–6 h)或 camptothecin 處理;陰性對(duì)照:未處理細(xì)胞 + Z-VAD-FMK(廣譜 Caspase 抑制劑)預(yù)處理。
  5. 數(shù)據(jù)分析:Caspase+ 細(xì)胞比例,或 Caspase MFI 比較。

方案4:TUNEL IF(免疫熒光檢測 DNA 斷裂)

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  1. 細(xì)胞接種于蓋玻片或腔室玻片,處理后用 4% 多聚甲醛(PFA)室溫固定 15–30 min。
  2. PBS 洗 3 次,0.1–0.2% Triton X-100 通透 10 min(或用 0.1% 檸檬酸鈉 + 0.1% Triton 通透)。
  3. PBS 洗 3 次,加 TdT 平衡緩沖液(Equilibration Buffer)室溫 10 min。
  4. 配制 TUNEL 反應(yīng)液:TdT 酶 + 熒光 dUTP(如 FITC-dUTP 或 Alexa Fluor 488-dUTP),37°C 避光孵育 60 min(濕度盒內(nèi))。
  5. PBS 洗 3 次,DAPI 或 Hoechst 33342 復(fù)染核 5 min。
  6. PBS 洗,抗熒光淬滅封片液封片,共聚焦或熒光顯微鏡觀察(488 nm 激發(fā)綠,405 nm 激發(fā)藍(lán)核)。
  7. 陽性對(duì)照:DNase I 處理(產(chǎn)生人工斷裂末端);陰性對(duì)照:不加 TdT 酶。
  8. 解讀:凋亡細(xì)胞核呈明亮綠色點(diǎn)狀/彌散熒光(TUNEL+),常伴核濃縮/碎裂;統(tǒng)計(jì) TUNEL+ 細(xì)胞比例或每視野 TUNEL+ 核數(shù)。

方案5:PARP 裂解 Western Blot

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  1. 細(xì)胞處理后,冰上用 RIPA 裂解液(含蛋白酶抑制劑 cocktail + 1 mM PMSF)裂解 30 min,每 10 min 渦旋一次。
  2. 4°C 12,000 g 離心 15 min,取上清,BCA 法蛋白定量(建議 20–40 μg/泳道)。
  3. SDS-PAGE(10% 分離膠),轉(zhuǎn) PVDF 膜,5% 脫脂奶粉封閉 1 h。
  4. 一抗:anti-PARP 抗體(1:1000,通常識(shí)別全長 116 kDa 和裂解 89 kDa 片段),4°C 過夜。
  5. TBST 洗 3 次,二抗(HRP 標(biāo)記,1:5000)室溫 1 h,TBST 洗 3 次。
  6. ECL 或超敏 ECL 顯影,ImageJ 定量裂解比例:裂解片段% = 89 kDa 灰度 / (116 kDa + 89 kDa) 灰度 × *。
  7. 內(nèi)參:β-actin 或 GAPDH;陽性對(duì)照:staurosporine 處理組裂解片段明顯增加。

四、數(shù)據(jù)解讀與常見問題

  • Annexin V/PI 四象限
    Q1 (Annexin- PI+) 壞死;Q2 (Annexin+ PI+) 晚凋亡;Q3 (Annexin+ PI-) 早期凋亡;Q4 活細(xì)胞。
  • JC-1
    紅/綠比下降 >30% → 早期凋亡。
  • Caspase-3
    活性升高 + Annexin V+ → 確認(rèn)凋亡通路。
  • Sub-G1
    比例 >5-10% → 凋亡增加,但需結(jié)合其他標(biāo)志。
  • 常見坑
    Annexin V 背景高 → 加 EDTA 對(duì)照;JC-1 毒性 → 濃度優(yōu)化;多參數(shù)補(bǔ)償串色 → 單染管校準(zhǔn)。

細(xì)胞凋亡檢測是多標(biāo)志物驗(yàn)證的過程,單一方法容易誤判。希望這篇全面指南幫你設(shè)計(jì)出可靠實(shí)驗(yàn),有任何具體問題歡迎留言討論~


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