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實(shí)驗(yàn)干貨 | 雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)手冊(cè)

前言:在分子生物學(xué)研究中,雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)(Dual-Luciferase Reporter Assay)是探究基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控、信號(hào)通路激活及分子相互作用的“金標(biāo)準(zhǔn)”。然而,許多同學(xué)在實(shí)驗(yàn)中常遇到數(shù)據(jù)波動(dòng)大、內(nèi)參不穩(wěn)、結(jié)果無(wú)法重復(fù)等問(wèn)題。本文將從底層原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、實(shí)操細(xì)節(jié)到數(shù)據(jù)處理,全方位拆解這一實(shí)驗(yàn)方案,助你從“實(shí)驗(yàn)小白”進(jìn)階為“技術(shù)大拿”。

*章:底層原理——為什么要用“雙”系統(tǒng)?

1. 核心邏輯:消除背景噪音

在單報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)中,熒光值的*大小受多種因素干擾: * 轉(zhuǎn)染效率:不同孔、不同批次的細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率差異巨大。 * 細(xì)胞活力:藥物處理或操作過(guò)程可能導(dǎo)致細(xì)胞數(shù)量和狀態(tài)不一。 * 操作誤差:加樣體積的微小偏差。

雙系統(tǒng)(Dual-System)通過(guò)引入一個(gè)不受實(shí)驗(yàn)處理影響的內(nèi)參報(bào)告基因,將實(shí)驗(yàn)組的*熒光值(Firefly)除以內(nèi)參組的熒光值(Renilla),得到相對(duì)熒光活性(Relative Luciferase Activity, RLA)。這種歸一化處理(Normalization)能*避免上述干擾。

2. 兩種酶的生化特性

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第二章:實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)——如何構(gòu)建你的“報(bào)告系統(tǒng)”?

1. 啟動(dòng)子活性分析(Promoter Assay)

  • 設(shè)計(jì)
    將待測(cè)啟動(dòng)子片段插入 pGL3/pGL4-Basic 載體(無(wú)啟動(dòng)子)上游。
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  • 截短實(shí)驗(yàn)
    通過(guò)構(gòu)建不同長(zhǎng)度的啟動(dòng)子片段,確定核心調(diào)控區(qū)域。
  • 突變實(shí)驗(yàn)
    對(duì)預(yù)測(cè)的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行點(diǎn)突變,驗(yàn)證其功能。

2. miRNA 靶基因驗(yàn)證(miRNA Targeting)

  • 設(shè)計(jì)
    將靶基因的 3'UTR 序列插入報(bào)告基因(Firefly)的下游。
  • 邏輯
    如果 miRNA 能結(jié)合該 3'UTR,會(huì)抑制 Firefly 的翻譯或降解其 mRNA,導(dǎo)致 Firefly/Renilla 比值下降。
  • 對(duì)照
    必須設(shè)置 3'UTR 突變組作為對(duì)照。

3. 信號(hào)通路監(jiān)測(cè)(Pathway Reporter)

  • 設(shè)計(jì)
    使用含有多個(gè)串聯(lián)響應(yīng)元件(如 NF-κB 結(jié)合位點(diǎn))的質(zhì)粒。
  • 應(yīng)用
    監(jiān)測(cè)藥物或刺激對(duì)特定通路的激活程度。
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第三章:實(shí)操手冊(cè)——以碧云天 RG027 試劑盒為例

1. 試劑準(zhǔn)備(避坑*步)

  • 細(xì)胞裂解液 (PLB)
    從冰箱取出后需恢復(fù)至室溫。
  • 螢火蟲底物工作液
    避光配制,現(xiàn)用現(xiàn)配。
  • 海腎底物工作液
    極其關(guān)鍵! 腔腸素在水溶液中極不穩(wěn)定,必須在使用前將腔腸素(100x)稀釋于海腎檢測(cè)緩沖液中。

2. 細(xì)胞處理與裂解

  1. 轉(zhuǎn)染
    推薦比例 Firefly : Renilla = 20:1 到 50:1。內(nèi)參信號(hào)過(guò)強(qiáng)會(huì)產(chǎn)生背景干擾,過(guò)弱則校正無(wú)效。
  2. 洗滌
    吸干培養(yǎng)基,用 PBS 洗滌 1-2 次。殘留的培養(yǎng)基(尤其是含酚紅的)會(huì)嚴(yán)重抑制熒光信號(hào)。
  3. 裂解
    24 孔板每孔加 100μL 裂解液,平搖 15min。技巧:裂解后可 12000rpm 離心 5min 取上清,減少細(xì)胞碎片對(duì)光路的散射。

3. 上機(jī)檢測(cè)(分秒必爭(zhēng))

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  • 加樣
    取 20μL 裂解液加入白色不透明 96 孔板。
  • 步驟 A
    加入 100μL 螢火蟲底物,混勻后立即讀數(shù)(測(cè)定 F 值)。
  • 步驟 B
    加入 100μL 海腎底物(含淬滅劑),混勻后立即讀數(shù)(測(cè)定 R 值)。
    • 注:淬滅劑會(huì)瞬間終止螢火蟲反應(yīng),效率通常 >99.9%。

    第四章:數(shù)據(jù)處理——從 RLU 到*終結(jié)論

    1. 原始數(shù)據(jù) (RLU)

    你將得到兩組數(shù)據(jù):Firefly RLU 和 Renilla RLU。

    2. 歸一化計(jì)算

    相對(duì)熒光活性 (RLA) =(Firefly RLU)/(Renilla RLU)

    3. 倍數(shù)變化 (Fold Change)

    將對(duì)照組的 RLA 設(shè)為 1,實(shí)驗(yàn)組 RLA 除以對(duì)照組 RLA。Fold Change =(實(shí)驗(yàn)組 RLA)/(對(duì)照組 RLA)

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    第五章:專家級(jí)注意事項(xiàng)(技術(shù)員必看)

    1. 嚴(yán)禁使用透明板! 透明板會(huì)產(chǎn)生嚴(yán)重的孔間串光(Crosstalk),導(dǎo)致假陽(yáng)性。必須使用全白板。
    2. 溫度控制
      熒光素酶對(duì)溫度極敏感。所有試劑必須恢復(fù)至室溫(20-25℃)再檢測(cè)。
    3. 讀數(shù)時(shí)間
      通常設(shè)置 2 秒延遲(Delay),10 秒積分(Integration)。
    4. 內(nèi)參選擇
      如果你的實(shí)驗(yàn)處理(如某些藥物)會(huì)影響 CMV 或 SV40 啟動(dòng)子,請(qǐng)更換內(nèi)參啟動(dòng)子(如 TK 啟動(dòng)子)。

    結(jié)語(yǔ)

    雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)雖是常規(guī)技能,但“魔鬼都在細(xì)節(jié)中”。掌握了內(nèi)參校正的精髓,注意底物穩(wěn)定性和耗材選擇,你就能獲得穩(wěn)定、可靠、高質(zhì)量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。

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